土壤和植物样品中的重金属消解：微波消解仪可用于处理土壤和植物样品中重金属的消解，适用于后续的原子吸收光谱（AAS）、电感耦合等离子体发射光谱（ICP-OES）或质谱（ICP-MS）分析。土壤样品消解通常使用HNO₃+HF+H₂O₂（或HClO₄）的酸体系，而植物样品消解则使用HNO₃+H₂O₂的酸体系。
水样中的重金属消解：微波消解仪可用于地表水、饮用水等水体中重金属元素的消解，以破坏水样中可能存在的有机质络合物、悬浮颗粒物，并使金属元素稳定存在于酸性介质中，为后续仪器分析的准确测定奠定基础。对于清澈水样，可直接摇匀后量取；对于含悬浮物水样，若测定重金属总量，不过滤，摇匀后直接量取浑浊水样进行消解
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